Produkte

Patogeniese molekulêre weë in sirrotiese lewersiektes soos hepatitis C-virus (HCV), outo-immuun hepatitis (AIH) en primêre biliêre sirrose (PBC) word swak gekarakteriseer.Differensieel uitgedrukte gene is dikwels belangrik in siektepatogenese.Onderdrukking subtraktiewe hibridisasie (SSH) is 'n genoomwye benadering wat verryk vir differensieel uitgedrukte mRNA-transkripsies.Ons het ten doel gehad om nuwe waarnemings te maak van differensiële geenuitdrukking in sirrose deur gebruik te maak van SSH gekombineer met kwantitatiewe intydse omgekeerde transkriptase polimerase kettingreaksie (RT-PCR).Lewertranskriptome in HCV-sirrose, AIH-sirrose, PBC en nie-siekte lewerweefsel is deur SSH ondersoek.Resulterende komplementêre DNA (cDNA) klone is hersif vir differensiële uitdrukking deur dot-blot hibridisasie en dan gevolgorde.Geselekteerde geenuitdrukking is gekwantifiseer deur intydse RT-PCR.Na aanleiding van SSH, is 694 klone weer gekeur vir differensiële geenuitdrukking, waarvan 145 gevolgorde is en gevind is om van 89 verskillende gene af te kom.Sewe klone was homoloog slegs met uitgedrukte volgorde merker (EST) volgordes wat kodeer vir gene wat geen bekende funksie het nie.Opgereguleerde uitdrukking van vier gene is bevestig deur intydse RT-PCR: transmembraan 4 superfamilielid 3 (tetraspanien CO-029) in alle vorme van sirrose, krimpvarkie interaksie proteïen (HIP) in AIH sirrose en chitinase 3-agtige-1 (HC gp-39 of ykl-40) en arginien-glutamiensuur-herhaling (RERE) in HCV-sirrose.RERE geen polimorfismes en splitsingsvariante is waargeneem in alle weefsels wat ondersoek is.Tetraspanien CO-029 opregulering was hoofsaaklik gelokaliseer na galbuiselle.Ten slotte, nuwe waarnemings van differensiële geenuitdrukking in menslike sirrose is gemaak deur SSH as die primêre ontdekkingsinstrument te gebruik.Veral verdere studies van die RERE-geen en sy produkte in HCV-geassosieerde lewersiekte is geregverdig.